PyMongoArrow は、大多数のBSON typesをサポートしています。 Arrow と Alerts はリストと構造体のファーストクラスのサポートを提供するため、これには埋め込み配列とドキュメントが含まれます。
その他のタイプのサポートは、後続のリリースで追加されます。
Tip
BSON types の詳細については、BSON仕様 を参照してください。
BSON 型 | タイプ識別子 |
|---|---|
文字列 |
|
embeddedDocument |
|
埋め込み配列 |
|
ObjectId |
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Decimal128 |
|
ブール値 |
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64 ビットのバイナリ浮動小数点 |
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32 ビット整数 |
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64 ビット整数 |
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UTC 日時 |
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バイナリ データ |
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JavaScript コード |
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null |
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注意
PyMongoArrow は、リトル エンディアン システムのみでDecimal128をサポートしています。 ビッグエンディアン システムでは、代わりにnullが使用されます。
型識別子 を使用して、 pymongoarrow.api.Schema宣言中にフィールドが特定の型であることを指定します。 たとえば、データに 32 ビット整数と UTC 日時のタイプを持つf1とf2と、 ObjectIdである_idがある場合は、次のようにスキーマを定義できます。
schema = Schema({ '_id': ObjectId, 'f1': pyarrow.int32(), 'f2': pyarrow.timestamp('ms')})スキーマでサポートされていないデータ型では、 ValueErrorがフィールドとそのデータ型を識別します。
埋め込み配列に関する考慮事項
埋め込み配列に使用されるスキーマでは、配列要素の型を指定するためにpyarrow.list_()型を使用する必要があります。 たとえば、
from pyarrow import list_, float64schema = Schema({'_id': ObjectId, 'location': {'coordinates': list_(float64())}})拡張タイプ
PyMongoArrow は、 ObjectId 、 Decimal128 、 Binary data 、 JavaScript code型を PyArrow および Pandoras の拡張型として実装します。 矢印テーブルの場合、これらの型の値には適切なpymongoarrow拡張タイプ( pymongoarrow.types.ObjectIdTypeなど)があります。 適切なbson Python オブジェクトを取得するには、 .as_py()メソッドを使用するか、テーブルで.to_pylist()を呼び出します。
>>> from pymongo import MongoClient>>> from bson import ObjectId>>> from pymongoarrow.api import find_arrow_all>>> client = MongoClient()>>> coll = client.test.test>>> coll.insert_many([{"_id": ObjectId(), "foo": 100}, {"_id": ObjectId(), "foo": 200}])<pymongo.results.InsertManyResult at 0x1080a72b0>>>> table = find_arrow_all(coll, {})>>> tablepyarrow.Table_id: extension<arrow.py_extension_type<ObjectIdType>>foo: int32----_id: [[64408B0D5AC9E208AF220142,64408B0D5AC9E208AF220143]]foo: [[100,200]]>>> table["_id"][0]<pyarrow.ObjectIdScalar: ObjectId('64408b0d5ac9e208af220142')>>>> table["_id"][0].as_py()ObjectId('64408b0d5ac9e208af220142')>>> table.to_pylist()[{'_id': ObjectId('64408b0d5ac9e208af220142'), 'foo': 100}, {'_id': ObjectId('64408b0d5ac9e208af220143'), 'foo': 200}]Pandoraに変換する場合、拡張タイプ列には適切なpymongoarrow拡張タイプ( pymongoarrow.pandas_types.PandasDecimal128など)があります。 データフレーム内の要素の値は適切なbsonタイプです。
>>> from pymongo import MongoClient>>> from bson import Decimal128>>> from pymongoarrow.api import find_pandas_all>>> client = MongoClient()>>> coll = client.test.test>>> coll.insert_many([{"foo": Decimal128("0.1")}, {"foo": Decimal128("0.1")}])<pymongo.results.InsertManyResult at 0x1080a72b0>>>> df = find_pandas_all(coll, {})>>> df _id foo0 64408bf65ac9e208af220144 0.11 64408bf65ac9e208af220145 0.1>>> df["foo"].dtype<pymongoarrow.pandas_types.PandasDecimal128 at 0x11fe0ae90>>>> df["foo"][0]Decimal128('0.1')>>> df["_id"][0]ObjectId('64408bf65ac9e208af220144')Tarlas は拡張タイプをサポートしていません。
NULL 値と Pandora Data Frames への変換
Arrow と Aggregation では、すべての配列が null 可能です。Pandora には、Int64 などの実験的な null 可能なデータ型があります。次のApacheドキュメント コードで、nullable dtypes を使用してpandas Data Frame を作成するよう Arrow に指示できます。
>>> dtype_mapping = {... pa.int8(): pd.Int8Dtype(),... pa.int16(): pd.Int16Dtype(),... pa.int32(): pd.Int32Dtype(),... pa.int64(): pd.Int64Dtype(),... pa.uint8(): pd.UInt8Dtype(),... pa.uint16(): pd.UInt16Dtype(),... pa.uint32(): pd.UInt32Dtype(),... pa.uint64(): pd.UInt64Dtype(),... pa.bool_(): pd.BooleanDtype(),... pa.float32(): pd.Float32Dtype(),... pa.float64(): pd.Float64Dtype(),... pa.string(): pd.StringDtype(),... }... df = arrow_table.to_pandas(... types_mapper=dtype_mapping.get, split_blocks=True, self_destruct=True... )... del arrow_tablepa.string()の変換を定義すると、オブジェクトではなく、Arrow string が NumPy string に変換されます。
ネストされた拡張タイプ
Pending ARROW-179、ネストされたドキュメントに表示される ObjectId などの拡張タイプは、対応する PyMongoArrow 拡張タイプに変換されず、代わりに未加工の Arrow タイプ FixedSizeBinaryType(fixed_size_binary[12]) になります。
これらの値はそのまま使用することも、 _id = out['nested'][0]['_id'].cast(ObjectIdType())などの目的の拡張タイプに個別に変換することもできます。
厳密な型の依存関係
PyMongoArrow v1.9 以降のデータのスキーマを提供すると、ドライバーは厳密な型強制を行います。フィールド値の型がそのフィールドのスキーマの型と一致しない場合、ドライバーは TypeError を発生させます。NaN はすべてのフィールドで有効なタイプです。
TypeErrors を抑制し、型の不一致を NaN に変換するには、allow_invalid=True 引数を使って pymongoarrow API を呼び出します。次の例ではallow_invalid=True を pymongoarrow API呼び出しに渡して、サンプルデータ内の不一致を NaN に変換します。
>>> from pymongoarrow.monkey import patch_all>>> from pymongoarrow.api import Schema, find_arrow_all>>> from pyarrow import int32, string>>> from pymongo import MongoClient>>> patch_all()>>> client = MongoClient()>>> coll = client.test.test>>> sample_data = [... {"name": "Alice", "age": 35, "city": "Chicago"},... {"name": {"first": "Bob", "last": "Smith"}, "age": 28, "city": "Boston"},... {"name": "Charlie", "age": "thirty-two", "city": "Seattle"}... ]>>> coll.insert_many(sample_data)>>> schema = Schema({... "name": string(),... "age": int32(),... "city": string()... })>>> result = find_arrow_all(collection, {}, schema=schema, allow_invalid=True)